この問題はバージョン2.0.20153.110または4.0.20153.110で修正されました。
修正版の適用方法については、アップデートの方法を参照してください。

修正版を適用しない場合の回避方法は次の通りです。

フォントサイズ変更後、C1TextBoxのAutoSizeプロパティにFalseを設定し、再度Trueを設定するとフォントサイズに一致した高さに変更されます。