この問題はバージョン5.20192.631で修正されました。

修正版を適用しない場合の回避方法は次の通りです。

itemFormatterで、値がマイナスの場合の表示色を設定します。

例：
-----------------------------------
waterfall.itemFormatter = function (engine, hitTestInfo, defaultRenderer) {
　　var ht = hitTestInfo,
　　　　binding = 'price';

　　// pointIndex == 0 の場合
　　if (ht.series.binding == binding && ht.pointIndex === 0 &&
　　　　ht.chartElement == wijmo.chart.ChartElement.SeriesSymbol) {

　　　// 現在値を取得します
　　　var chart = ht.series.chart,
　　　　　items = chart.collectionView.items,
　　　　　valNow = items[ht.pointIndex][binding];

　　　// 先頭の値がマイナスの場合は赤色で描画します
　　　if (valNow < 0) {
　　　　　engine.fill = 'red';
　　　　　engine.stroke = 'red';
　　　}
　　}
　　
　　// 要素を通常通りに描画します
　　defaultRenderer();
}
-----------------------------------