できます。
InputMan for ASP.NET 10.0Jの各コントロールでは、jQuery APIの利用をサポートしています。
デモアプリケーションの「jQuery APIの利用」では、実際にjQuery APIの使用例を紹介しており、またjQueryコードを実際に試すことも可能になっています。

そのほかのコントロールに関しても、jQueryセレクタ―をサポートします。「$("#GcComboBox1")」というようなjQuery構文でInputManコントロールのオブジェクトの取得や、クライアント側イベントのハンドルができます。

jQueryの使用方法については製品ヘルプの下記の項目を参照してください。

[PowerTools InputMan for ASP.NET 10.0J]
　- [InputMan for ASP.NETの使い方]
　　- [jQueryの使用]