凡例をデータセットのインデックス順とは逆の順序で表示するには、ChartGroup.LegendReversedプロパティを設定します。
なお、インデックス順／逆順ではなく任意の順序に設定する機能はございません。

C1Chart1.ChartGroups(0).LegendReversed = True

2つのグラフグループ（Group0／Group1）がある場合に、凡例内のグラフグループの順序を逆順にするには、Legend.Reversedプロパティを設定します。

C1Chart1.Legend.Reversed = True