SaveGridメソッドで、FileFlagsにVisibleOnlyを指定すると、フィルタリング後の結果のみ出力されます。

◆サンプルコード
[Visual Basic]
C1FlexGrid1.SaveGrid("c:¥test1.csv", C1.Win.C1FlexGrid.FileFormatEnum.TextComma, _
　　　C1.Win.C1FlexGrid.FileFlags.VisibleOnly)

[C#]
c1FlexGrid1.SaveGrid(@"c:¥test1.csv", C1.Win.C1FlexGrid.FileFormatEnum.TextComma,
　　　C1.Win.C1FlexGrid.FileFlags.VisibleOnly);