この問題は、InputManJS V2.2Jで修正されました。

修正版を適用しない場合の回避方法は次の通りです。

無効化された場合に、コンボコントロールのparentElementにマウスホイールのイベントハンドラを登録してホイール操作をキャンセルします。

【サンプルコード】
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var c = document.getElementById("gcComboBox1").parentElement;

// for IE/Edge/Chrome/Safari
c.addEventListener("mousewheel", function(e) {
　　e.stopPropagation();
　　e.cancelBubble = true;
}, true);

// for Firefox
c.addEventListener("DOMMouseScroll", function(e){
　　e.stopPropagation();
　　e.cancelBubble = true;
}, true);
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