散布図において、ある矩形範囲（X値、Y値の範囲で指定）の背景色を変更するには、RenderedイベントとPaintイベントを利用します。

最初にRenderedイベントで、指定した矩形範囲をコントロール座標に変換します（DataToPointメソッドを使用）。次いでPaintイベントにて、e.Graphics.FillRectangleメソッドを用いてこの矩形を塗りつぶします。

※ この方法でアラームゾーンを代用することが可能です。

以下に、X＝200～600、Y＝400～800の矩形範囲を黄色に染めるサンプルを記載します。



◎サンプルコード（VB）

Imports C1.Chart
Imports C1.Win.Chart

Public Class Form1

    Dim posA1 As Point
    Dim posA2 As Point
    Dim isFirstTime As Boolean = True

    Private Sub Form1_Load(sender As Object, e As EventArgs) Handles MyBase.Load
        ' データの作成
        Dim dt As New DataTable()
        dt.Columns.AddRange({New DataColumn("X", GetType(Double)), New DataColumn("Y", GetType(Double))})
        Dim r As New Random()
        For i = 0 To 99
            dt.Rows.Add(r.Next(1, 1000), r.Next(1, 1000))
        Next
        dt.AcceptChanges()

        ' 散布図の作成チャートの設定
        Dim series1 As New Series()
        series1.ChartType = ChartType.Scatter
        series1.BindingX = "X"
        series1.Binding = "Y"
        series1.DataSource = dt
        series1.SymbolStyle.FillColor = Color.LightBlue
        series1.SymbolStyle.StrokeColor = Color.LightBlue
        series1.SymbolSize = 5
        FlexChart1.Series.Clear()
        FlexChart1.Series.Add(series1)

        ' 軸の設定
        FlexChart1.AxisX.Min = 0
        FlexChart1.AxisX.Max = 1000
        FlexChart1.AxisY.Min = 0
        FlexChart1.AxisY.Max = 1000
    End Sub

    Private Sub FlexChart1_Rendered(sender As Object, e As RenderEventArgs) Handles FlexChart1.Rendered
        If isFirstTime Then
            ' フラグの初期化
            isFirstTime = False
            ' 描画領域の取得
            posA1 = Point.Truncate(FlexChart1.DataToPoint(New PointF(200.0F, 800.0F)))
            posA2 = Point.Truncate(FlexChart1.DataToPoint(New PointF(600.0F, 400.0F)))
            ' 描画の強制
            FlexChart1.Invalidate()
        End If
    End Sub

    Private Sub FlexChart1_Paint(sender As Object, e As PaintEventArgs) Handles FlexChart1.Paint
        ' 矩形の塗りつぶし（X値が200～600、Y値が400～800の間）
        e.Graphics.FillRectangle(Brushes.Yellow, New Rectangle(posA1, New Size(Math.Abs(posA2.X - posA1.X), Math.Abs(posA2.Y - posA1.Y))))
    End Sub
End Class

◎サンプルコード（C#）

using C1.Chart;
using C1.Win.Chart;

namespace prj_C1FlexChart
{
    public partial class Form1 : Form
    {
        Point posA1;
        Point posA2;
        bool isFirstTime = true;

        public Form1()
        {
            InitializeComponent();

            // データの作成
            DataTable dt = new DataTable();
            dt.Columns.AddRange(new DataColumn[]{new DataColumn("X", typeof(Int32)), new DataColumn("Y", typeof(Int32))});
            Random r = new Random();
            for (var i = 0; i <= 99; i++)
                dt.Rows.Add(r.Next(1, 1000), r.Next(1, 1000));
            dt.AcceptChanges();

            // 散布図の作成チャートの設定
            Series series1 = new Series();
            series1.ChartType = ChartType.Scatter;
            series1.BindingX = "X";
            series1.Binding = "Y";
            series1.DataSource = dt;
            series1.SymbolStyle.FillColor = Color.LightBlue;
            series1.SymbolStyle.StrokeColor = Color.LightBlue;
            series1.SymbolSize = 5;
            flexChart1.Series.Clear();
            flexChart1.Series.Add(series1);

            // 軸の設定
            flexChart1.AxisX.Min = 0;
            flexChart1.AxisX.Max = 1000;
            flexChart1.AxisY.Min = 0;
            flexChart1.AxisY.Max = 1000;
        }

        private void flexChart1_Rendered(object sender, RenderEventArgs e)
        {
            if (isFirstTime)
            {
                // フラグの初期化
                isFirstTime = false;
                // 描画領域の取得
                posA1 = Point.Truncate(flexChart1.DataToPoint(new PointF(200.0F, 800.0F)));
                posA2 = Point.Truncate(flexChart1.DataToPoint(new PointF(600.0F, 400.0F)));
                // 描画の強制
                flexChart1.Invalidate();
            }
        }

        private void flexChart1_Paint(object sender, PaintEventArgs e)
        {
            // 矩形の塗りつぶし（X値が200～600、Y値が400～800の間）
            e.Graphics.FillRectangle(Brushes.Yellow, new Rectangle(posA1, new Size(Math.Abs(posA2.X - posA1.X), Math.Abs(posA2.Y - posA1.Y))));
        }
    }
}