本現象は、Acrobat Readerの印刷設定により発生しています。

Acrobat Readerから[印刷]ダイアログを表示し、「ページサイズ処理」の設定をご確認ください。「実際のサイズ」以外がチェックされている場合、印刷結果が縮小（拡大）されたり、印刷位置がずれる可能性があります。
（本設定は、作成したPDFに含まれている情報ではなく、Acrobat Reader自身の設定です。）

詳細につきましては、アドビシステムズ社のWebサイトに情報がございますので、こちらをご参照ください。

基本の PDF 印刷処理 - Acrobat、Reader

印刷時にページを拡大または縮小する方法（Acrobat DC/Acrobat Reader DC）

また、プリンタドライバの機能や設定が関係している可能性もありますので、そちらの方もご確認ください。

なお、上記の設定はAcrobat Reader自身の設定ですが、印刷プリセットを含んだPDFを出力することで、これらの設定を制御可能な場合もあります。詳しくは、後述の「関連情報」にあるナレッジ文書『印刷設定（両面印刷、拡大／縮小の有無など）付きのPDFを作成できますか？』をご覧ください。