PDFへの出力がサポートされていないチャートを含むxlsxをPDFエクスポートした際、それらのチャートがレンダリングされてしまいます。
本来は、未サポートのチャートはPDFにレンダリングされないのが正しい動作です。

現時点で、PDFへの出力がサポートされていないチャートは以下のとおりです。

Area3D
AreaStacked3D
AreaStacked1003D
BarClustered3D
BarOfPie
BarStacked3D
BarStacked1003D
BoxWhisker
Bubble3DEffect
Column3D
ColumnClustered3D
ColumnStacked3D
ColumnStacked1003D
Funnel
Histogram
Line3D
Pareto
Pie3D
PieExploded3D
PieOfPie
Surface
SurfaceTopView
SurfaceTopViewWireframe
SurfaceWireframe
Waterfall