値が論理値のセルに、セルの値ルールの条件付き書式が設定されている場合、そのセルをPDFに出力すると、条件付き書式がPDFに反映されません。
なお、セルの値ルールの条件付き書式は、IFormatConditions.Addメソッドにて条件付き書式設定を追加する際に、タイプとしてFormatConditionType.CellValueを指定することで追加できるルールです。

この問題はバージョン6.2.2で修正されました。