透明度が設定された特殊な図形（※注）を含むxlsxファイルを読み込み、xlsxとして保存すると、該当の図形の透明度が保持されず0%になります。

※注
この場合の「特殊な図形」とは、xlsxファイルの拡張子をzipに変更後、解凍して得られる内部ファイル「xl\drawings\drawing*.xml」にて、下記のように古い形式であるscrgbClrノード内にalpha値が記載されている図形です。

<sa:solidFill>
    <sa:scrgbClr r="0" g="0" b="0">
        <sa:alpha val="0"/>
    <s/a:scrgbClr>
<s/a:solidFill>

MS Excelで作成した場合など、通常は、下記のようにschemeClrノード内のalpha値にて記載されます。

<sa:solidFill>
    <a:schemeClr val="tx1">
        <a:alpha val="0"/>
    </a:schemeClr>
<s/a:solidFill>

この問題はバージョン6.2.2で修正されました。